El 14 de junio de 1961 se levanta el acta de fundación del Instituto Bíblico San Juanillo por los hermanos. Donaldo y Kati Gale.

El concilio de la misión estaba preocupado porque en Chuquisaca no crecía la obra, sugirió a la misión fundar un centro de entrenamiento para la obra del Señor, el concilio les invitó para fundar el instituto bíblico.

El instituto da inicio a su entrenamiento en la avenida Jaime Mendoza frente a la iglesia Dios es Amor dando inicio a la actividad de preparación el 14 de junio de 1961, con un numero de 8 alumnos, continuando la gestión con 5 alumnos.

Ante la necesidad de contar con un edificio propio buscamos una propiedad. Se presenta San juanillo a un precio de 28.000 dólares, se realizan las tratativas y por fin se logra comprar a un precio de 14.000 dólares.

En noviembre del 1964 el instituto también tenía programas radiales que se dieron inicio en septiembre del 1961 a 1971 y se transmitían en el idioma Quechua en el programa Sumaj Michej que eran pasados por la radio Nuevo Mundo los días miércoles y sábados de cada semana.

Se consolida la compra previa verificación del director de la misión don José Mccullough y el director emérito, el director Verne Roberts de la Misión Andina. El primer año de ser dueños se pudo realizar estudios de preparación y se construyen 4 dormitorios para señoritas.

El instituto por esa fecha, tenía el nombre de Instituto Bíblico de Sucre, pero por el nombre que tenía la propiedad se llegó a poner Instituto Bíblico San Juanillo.

La meta y objetivo del instituto es “la preparación bíblica a los creyentes fieles para que ellos puedan enseñar a otros”. 2 Timoteo 2:2: “como obreros que no tienen de que avergonzarse que usan bien la palabra de verdad” (lema de nuestra institución) así es fundado también para ser un centro de ayuda a las iglesias y creyentes de toda la región.

En el año 2005, por la confusión de nombre con la escuela San Juanillo, y porque el nombre representa un ídolo que antes estaba en la propiedad, el comité ejecutivo nacional de la unión cristiana evangélica en forma unánime y total conformidad, se decide cambiar el nombre a Seminario Teológico del Sur – SETESUR.

Se da inicio a nuevos programas como profesorado para luego dar inicio en el 2008 el programa de licenciatura, contando también con una nueva infraestructura.

Y en el año 2022 se comienza el programa de maestría.

Por nuestra institución pasaron muchos estudiantes, algunos aún en la obra del señor, otros ya pasaron a la presencia del señor, que dieron fruto de los cuales nos sentimos muy orgullosos.

También pasaron muchos docentes por las aulas del seminario cumpliendo su labor de instruir, capacitar y formar al estudiante para una labor integral en su vida y ministerio.

Queremos recordar a los diferentes rectores, misioneros y hermanos que apoyaron en el crecimiento de SETESUR y agradeciendo su labor sacrificada en la obra de nuestro gran Dios, mencionando a aquellos que nos acordamos, sin desmerecer a otros que tal vez no mencionamos por no tener registros de todos los que pasaron por nuestra institución y pidiendo perdón por no mencionarlos.

Mro. Donaldo Gale (fundador y director del IBSJ) (1961-1970)

Mro. Ronaldo Tamplin (director ISBJ) (1971-1972)

Mro. Raymundo Morris (director ISBJ) (1973 – 1974)

Ptr. José Manuel Choque (director ISBJ) (1975 – 1978)

Ptr. Enrique Rocha (director ISBJ) (1979 – 1980)

Ptr. Florentino Chipana (director ISBJ) (1981 – 1985)

Ptr. Benedicto Ibarra (director ISBJ) (1986 – 1995)

Ptr. Eduardo Barja (director IBSJ) (1996 – 1997)

Lic. Juan Carlos Lafuente (director ISBJ) (1998 – 2003)

Dra. Eneida Salazar (directora IBSJ) (2004)

Lic. Eduardo Barja (rector SETESUR) (2005 – 2014)

Lic. Euler Enovore (rector SETESUR) (2015)

Lic. Gumercindo Atto (rector SETESUR) (2016-2019)

Lic. Ángel Valeriano (rector SETESUR) (2020)

Lic. Freddy Vera (rector SETESUR actualmente) (2021 – 2024)